Система менеджмента качества ФГУП «Госкорпорация по ОрВД» является инструментом для непрерывного улучшения деятельности предприятия с учетом потребностей всех заинтересованных сторон - потребителей аэронавигационных услуг, государства, общества, работников предприятия и т.д.
В основе работы филиала по достижению высокого качества аэронавигационного обслуживания лежит постоянное совершенствование системы процессов предприятия - основных, обеспечивающих и регулирующих.

21 декабря 2006 года в филиале «МЦ АУВД» ФГУП «Госкорпорация по ОрВД» был проведен внешний аудит на соответствие международному стандарту ISO 9001:2000.
Проведенные в филиале как внутренний, так и внешний аудиты подтвердили соответствие созданной в филиале системы менеджмента качества международному стандарту ISO 9001:2000, а также хорошую работу, проделанную персоналом управления по приведению деятельности филиала в соответствие с требованиями, предъявляемыми международным стандартом ISO 9001:2000.

22 – 23 января 2008 года в филиале «МЦ АУВД» ФГУП «Госкорпорация по ОрВД» проведен первый надзорный аудит системы менеджмента качества предприятия на соответствие международному стандарту ISO 9001:2000.
Проведенные в филиале в течение 2007 года внутренние аудиты, значительный объем выполненной  работы по доведению технической документации подразделений филиала до требований стандартов предприятия, а также итоги надзорного аудита подтвердили положительную динамику развития системы менеджмента качества филиала, ее соответствие требованиям международного стандарта ISO 9001:2000.